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1988. En marzo se celebran elecciones legislativas que dan la mayoría a la Alianza Republicana Nacional (ARENA).

1991. El 10 de marzo, elecciones legislativas y municipales, con la victoria del partido Alianza Republicana Nacionalista. Firma en México del acuerdo de Paz.

1992. Representantes gubernamentales y de la guerrilla firman un acuerdo por el que finaliza la guerra civil. El guerrillero Frente Farabundo Martí de Liberación Nacional (FMLN) se constituye en partido político y es legalizado como agrupación política.

1994. Armando Calderón Sol accede a la presidencia de la República tras la victoria del ARENA en unas elecciones presidenciales, legislativas y municipales en las que participó por primera vez como partido político el grupo guerrillero Frente Farabundo Martí de Liberación Nacional (FMLN).

1997. En las elecciones generales de marzo, el FMLN alcanza 27 representantes, uno menos que ARENA. En las elecciones municipales, el primer partido en coalición con otras fuerzas políticas logra la alcaldía de la capital y de otras 5 ciudades principales. La ONU mantiene una misión en el país para controlar el cumplimiento de los acuerdos de paz.

1998. El huracán Mitch afecta a la zona oriental del país, causando graves daños.

1999. El crecimiento económico este año se ve afectado por la reconstrucción de los daños en las infraestructuras causadas por el Mitch.

2000. El presidente Flores intenta llevar adelante su programa de reforma "desde dentro" para acabar con la inseguridad en el país.